Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tuba4aP68368 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tuba4aP68368 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tuba4aP68368 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tuba4aP68368 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms