Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp2P63044 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp2P63044 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp2P63044 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp2P63044 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp2P63044 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp2P63044 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp2P63044 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp2P63044 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp2P63044 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp2P63044 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp2P63044 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp2P63044 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp2P63044 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp2P63044 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp2P63044 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp2P63044 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp2P63044 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp2P63044 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp2P63044 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp2P63044 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp2P63044 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms