Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbpl1P62340 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbpl1P62340 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbpl1P62340 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbpl1P62340 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbpl1P62340 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbpl1P62340 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbpl1P62340 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbpl1P62340 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbpl1P62340 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tbpl1P62340 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms