Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps29P62274 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps29P62274 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps29P62274 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rps29P62274 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps29P62274 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps29P62274 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps29P62274 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps29P62274 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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