Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Eif3eP60229 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Eif3eP60229 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eif3eP60229 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eif3eP60229 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eif3eP60229 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eif3eP60229 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Eif3eP60229 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Eif3eP60229 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Eif3eP60229 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Eif3eP60229 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Eif3eP60229 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Eif3eP60229 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Eif3eP60229 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Eif3eP60229 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Eif3eP60229 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eif3eP60229 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Eif3eP60229 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eif3eP60229 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eif3eP60229 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eif3eP60229 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eif3eP60229 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Eif3eP60229 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Eif3eP60229 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eif3eP60229 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eif3eP60229 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eif3eP60229 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eif3eP60229 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eif3eP60229 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eif3eP60229 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Eif3eP60229 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms