Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcif1P59114 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcif1P59114 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcif1P59114 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcif1P59114 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcif1P59114 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcif1P59114 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcif1P59114 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcif1P59114 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcif1P59114 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcif1P59114 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcif1P59114 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcif1P59114 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcif1P59114 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcif1P59114 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcif1P59114 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcif1P59114 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcif1P59114 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcif1P59114 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms