Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Setd4P58467 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Setd4P58467 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Setd4P58467 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd4P58467 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd4P58467 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setd4P58467 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd4P58467 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd4P58467 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Setd4P58467 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Setd4P58467 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Setd4P58467 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Setd4P58467 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Setd4P58467 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Setd4P58467 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Setd4P58467 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Setd4P58467 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Setd4P58467 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Setd4P58467 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Setd4P58467 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Setd4P58467 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Setd4P58467 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Setd4P58467 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd4P58467 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd4P58467 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd4P58467 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Setd4P58467 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Setd4P58467 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Setd4P58467 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Setd4P58467 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Setd4P58467 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd4P58467 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd4P58467 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd4P58467 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setd4P58467 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setd4P58467 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Setd4P58467 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Setd4P58467 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setd4P58467 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd4P58467 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd4P58467 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd4P58467 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd4P58467 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms