Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sssca1P56873 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sssca1P56873 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sssca1P56873 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Sssca1P56873 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sssca1P56873 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sssca1P56873 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sssca1P56873 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms