Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab8aP55258 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab8aP55258 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab8aP55258 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms