Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr1cP52432 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Polr1cP52432 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1cP52432 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms