Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apobec1P51908 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Apobec1P51908 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apobec1P51908 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Apobec1P51908 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec1P51908 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms