Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Defa-rs12P50716 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Defa-rs12P50716 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Defa-rs12P50716 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Defa-rs12P50716 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Defa-rs12P50716 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Defa-rs12P50716 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Defa-rs12P50716 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Defa-rs12P50716 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Defa-rs12P50716 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Defa-rs12P50716 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Defa-rs12P50716 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Defa-rs12P50716 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Defa-rs12P50716 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Defa-rs12P50716 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Defa-rs12P50716 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Defa-rs12P50716 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Defa-rs12P50716 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Defa-rs12P50716 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Defa-rs12P50716 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Defa-rs12P50716 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Defa-rs12P50716 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Defa-rs12P50716 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Defa-rs12P50716 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Defa-rs12P50716 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Defa-rs12P50716 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Defa-rs12P50716 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Defa-rs12P50716 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Defa-rs12P50716 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Defa-rs12P50716 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Defa-rs12P50716 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms