Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa6P50704 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa6P50704 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa6P50704 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa6P50704 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa6P50704 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa6P50704 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa6P50704 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa6P50704 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa6P50704 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.9 ms