Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxc13P50207 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxc13P50207 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxc13P50207 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxc13P50207 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxc13P50207 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxc13P50207 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxc13P50207 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxc13P50207 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxc13P50207 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxc13P50207 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxc13P50207 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxc13P50207 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxc13P50207 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc13P50207 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms