Protein–RNA interactions for Protein: P47739

Aldh3a1, Aldehyde dehydrogenase, dimeric NADP-preferring, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3a1P47739 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh3a1P47739 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh3a1P47739 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh3a1P47739 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh3a1P47739 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh3a1P47739 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh3a1P47739 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh3a1P47739 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh3a1P47739 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aldh3a1P47739 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aldh3a1P47739 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Aldh3a1P47739 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh3a1P47739 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Aldh3a1P47739 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh3a1P47739 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms