Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 524.9 ms