Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upk2P38575 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upk2P38575 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upk2P38575 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upk2P38575 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upk2P38575 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upk2P38575 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upk2P38575 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upk2P38575 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upk2P38575 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk2P38575 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upk2P38575 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upk2P38575 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upk2P38575 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upk2P38575 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Upk2P38575 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upk2P38575 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upk2P38575 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upk2P38575 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Upk2P38575 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upk2P38575 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upk2P38575 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upk2P38575 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upk2P38575 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Upk2P38575 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upk2P38575 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upk2P38575 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms