Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn1P35821 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn1P35821 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn1P35821 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn1P35821 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn1P35821 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn1P35821 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn1P35821 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn1P35821 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn1P35821 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn1P35821 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn1P35821 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn1P35821 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn1P35821 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn1P35821 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn1P35821 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn1P35821 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn1P35821 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn1P35821 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn1P35821 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn1P35821 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn1P35821 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn1P35821 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn1P35821 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn1P35821 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms