Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ly6dP35459 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ly6dP35459 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ly6dP35459 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ly6dP35459 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ly6dP35459 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ly6dP35459 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ly6dP35459 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ly6dP35459 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ly6dP35459 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ly6dP35459 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ly6dP35459 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ly6dP35459 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ly6dP35459 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ly6dP35459 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ly6dP35459 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ly6dP35459 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ly6dP35459 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ly6dP35459 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ly6dP35459 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ly6dP35459 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ly6dP35459 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ly6dP35459 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ly6dP35459 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ly6dP35459 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ly6dP35459 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ly6dP35459 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ly6dP35459 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ly6dP35459 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ly6dP35459 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ly6dP35459 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ly6dP35459 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ly6dP35459 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ly6dP35459 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ly6dP35459 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ly6dP35459 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ly6dP35459 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ly6dP35459 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ly6dP35459 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ly6dP35459 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ly6dP35459 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ly6dP35459 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ly6dP35459 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ly6dP35459 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ly6dP35459 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ly6dP35459 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ly6dP35459 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ly6dP35459 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ly6dP35459 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ly6dP35459 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ly6dP35459 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ly6dP35459 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ly6dP35459 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ly6dP35459 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ly6dP35459 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ly6dP35459 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ly6dP35459 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ly6dP35459 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ly6dP35459 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ly6dP35459 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ly6dP35459 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ly6dP35459 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ly6dP35459 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ly6dP35459 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.9 ms