Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TpoP35419 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TpoP35419 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TpoP35419 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TpoP35419 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TpoP35419 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TpoP35419 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TpoP35419 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TpoP35419 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TpoP35419 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TpoP35419 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TpoP35419 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TpoP35419 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TpoP35419 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TpoP35419 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TpoP35419 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TpoP35419 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TpoP35419 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TpoP35419 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
TpoP35419 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TpoP35419 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TpoP35419 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TpoP35419 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TpoP35419 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TpoP35419 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TpoP35419 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TpoP35419 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TpoP35419 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TpoP35419 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TpoP35419 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TpoP35419 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TpoP35419 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TpoP35419 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TpoP35419 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TpoP35419 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TpoP35419 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TpoP35419 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TpoP35419 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TpoP35419 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TpoP35419 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TpoP35419 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TpoP35419 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TpoP35419 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TpoP35419 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TpoP35419 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TpoP35419 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TpoP35419 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TpoP35419 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TpoP35419 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TpoP35419 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TpoP35419 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TpoP35419 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TpoP35419 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TpoP35419 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TpoP35419 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TpoP35419 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TpoP35419 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TpoP35419 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TpoP35419 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TpoP35419 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TpoP35419 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TpoP35419 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TpoP35419 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TpoP35419 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TpoP35419 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TpoP35419 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TpoP35419 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TpoP35419 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TpoP35419 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TpoP35419 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TpoP35419 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TpoP35419 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TpoP35419 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TpoP35419 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TpoP35419 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TpoP35419 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TpoP35419 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TpoP35419 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TpoP35419 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TpoP35419 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TpoP35419 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TpoP35419 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TpoP35419 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TpoP35419 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TpoP35419 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TpoP35419 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TpoP35419 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TpoP35419 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TpoP35419 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TpoP35419 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TpoP35419 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TpoP35419 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TpoP35419 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TpoP35419 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TpoP35419 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TpoP35419 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TpoP35419 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TpoP35419 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TpoP35419 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TpoP35419 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms