Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxc5P32043 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc5P32043 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc5P32043 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms