Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tacr1P30548 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tacr1P30548 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tacr1P30548 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tacr1P30548 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tacr1P30548 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tacr1P30548 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tacr1P30548 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tacr1P30548 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tacr1P30548 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tacr1P30548 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tacr1P30548 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tacr1P30548 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tacr1P30548 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tacr1P30548 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tacr1P30548 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tacr1P30548 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tacr1P30548 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tacr1P30548 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tacr1P30548 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tacr1P30548 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tacr1P30548 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tacr1P30548 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tacr1P30548 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tacr1P30548 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tacr1P30548 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms