Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Cnga1P29974 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Cnga1P29974 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Cnga1P29974 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cnga1P29974 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
Cnga1P29974 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cnga1P29974 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cnga1P29974 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cnga1P29974 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cnga1P29974 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cnga1P29974 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Cnga1P29974 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Cnga1P29974 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Cnga1P29974 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms