Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BgnP28653 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BgnP28653 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BgnP28653 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BgnP28653 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BgnP28653 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BgnP28653 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BgnP28653 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BgnP28653 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BgnP28653 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BgnP28653 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BgnP28653 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BgnP28653 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BgnP28653 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BgnP28653 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BgnP28653 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BgnP28653 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BgnP28653 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BgnP28653 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BgnP28653 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BgnP28653 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BgnP28653 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BgnP28653 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BgnP28653 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BgnP28653 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BgnP28653 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BgnP28653 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BgnP28653 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BgnP28653 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BgnP28653 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BgnP28653 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BgnP28653 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BgnP28653 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BgnP28653 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BgnP28653 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BgnP28653 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BgnP28653 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BgnP28653 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BgnP28653 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BgnP28653 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BgnP28653 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BgnP28653 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BgnP28653 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BgnP28653 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BgnP28653 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BgnP28653 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BgnP28653 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BgnP28653 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BgnP28653 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BgnP28653 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BgnP28653 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BgnP28653 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BgnP28653 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BgnP28653 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BgnP28653 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BgnP28653 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BgnP28653 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BgnP28653 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BgnP28653 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BgnP28653 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BgnP28653 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BgnP28653 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BgnP28653 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BgnP28653 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BgnP28653 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BgnP28653 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BgnP28653 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BgnP28653 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BgnP28653 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BgnP28653 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BgnP28653 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BgnP28653 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BgnP28653 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BgnP28653 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BgnP28653 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BgnP28653 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BgnP28653 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BgnP28653 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BgnP28653 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BgnP28653 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BgnP28653 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BgnP28653 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BgnP28653 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BgnP28653 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BgnP28653 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BgnP28653 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BgnP28653 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BgnP28653 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BgnP28653 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BgnP28653 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BgnP28653 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BgnP28653 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BgnP28653 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BgnP28653 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BgnP28653 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BgnP28653 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BgnP28653 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BgnP28653 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BgnP28653 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BgnP28653 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms