Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdgfraP26618 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdgfraP26618 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdgfraP26618 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdgfraP26618 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PdgfraP26618 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PdgfraP26618 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PdgfraP26618 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PdgfraP26618 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PdgfraP26618 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdgfraP26618 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdgfraP26618 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PdgfraP26618 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PdgfraP26618 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PdgfraP26618 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PdgfraP26618 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PdgfraP26618 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms