Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bmi1P25916 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bmi1P25916 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bmi1P25916 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms