Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd12P23812 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd12P23812 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd12P23812 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd12P23812 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd12P23812 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd12P23812 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd12P23812 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd12P23812 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd12P23812 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd12P23812 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd12P23812 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd12P23812 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd12P23812 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd12P23812 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd12P23812 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd12P23812 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Hoxd12P23812 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd12P23812 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd12P23812 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd12P23812 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd12P23812 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd12P23812 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd12P23812 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd12P23812 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd12P23812 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd12P23812 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd12P23812 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd12P23812 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd12P23812 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd12P23812 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd12P23812 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd12P23812 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd12P23812 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd12P23812 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxd12P23812 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd12P23812 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms