Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmt1P23506 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcmt1P23506 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcmt1P23506 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pcmt1P23506 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pcmt1P23506 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Pcmt1P23506 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcmt1P23506 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcmt1P23506 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcmt1P23506 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcmt1P23506 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcmt1P23506 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms