Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PparaP23204 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PparaP23204 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PparaP23204 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PparaP23204 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PparaP23204 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PparaP23204 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PparaP23204 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PparaP23204 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PparaP23204 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PparaP23204 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PparaP23204 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PparaP23204 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PparaP23204 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PparaP23204 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PparaP23204 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PparaP23204 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PparaP23204 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PparaP23204 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PparaP23204 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PparaP23204 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PparaP23204 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PparaP23204 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PparaP23204 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PparaP23204 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PparaP23204 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PparaP23204 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PparaP23204 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PparaP23204 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PparaP23204 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PparaP23204 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PparaP23204 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PparaP23204 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PparaP23204 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PparaP23204 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PparaP23204 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PparaP23204 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PparaP23204 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PparaP23204 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PparaP23204 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PparaP23204 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PparaP23204 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PparaP23204 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PparaP23204 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PparaP23204 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PparaP23204 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PparaP23204 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PparaP23204 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PparaP23204 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PparaP23204 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PparaP23204 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PparaP23204 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PparaP23204 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PparaP23204 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PparaP23204 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PparaP23204 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PparaP23204 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PparaP23204 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PparaP23204 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PparaP23204 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PparaP23204 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PparaP23204 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PparaP23204 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PparaP23204 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PparaP23204 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PparaP23204 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PparaP23204 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PparaP23204 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PparaP23204 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PparaP23204 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PparaP23204 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PparaP23204 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PparaP23204 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PparaP23204 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PparaP23204 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PparaP23204 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PparaP23204 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PparaP23204 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PparaP23204 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PparaP23204 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PparaP23204 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PparaP23204 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PparaP23204 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PparaP23204 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PparaP23204 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PparaP23204 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PparaP23204 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PparaP23204 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PparaP23204 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PparaP23204 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PparaP23204 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PparaP23204 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PparaP23204 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PparaP23204 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PparaP23204 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PparaP23204 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PparaP23204 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PparaP23204 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PparaP23204 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PparaP23204 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms