Protein–RNA interactions for Protein: P22005

Penk, Proenkephalin-A, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PenkP22005 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PenkP22005 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PenkP22005 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PenkP22005 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PenkP22005 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PenkP22005 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PenkP22005 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PenkP22005 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PenkP22005 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PenkP22005 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PenkP22005 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PenkP22005 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PenkP22005 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PenkP22005 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PenkP22005 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PenkP22005 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PenkP22005 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PenkP22005 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PenkP22005 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PenkP22005 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PenkP22005 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PenkP22005 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PenkP22005 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PenkP22005 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PenkP22005 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PenkP22005 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PenkP22005 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PenkP22005 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PenkP22005 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PenkP22005 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PenkP22005 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PenkP22005 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PenkP22005 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PenkP22005 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PenkP22005 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PenkP22005 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PenkP22005 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PenkP22005 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PenkP22005 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PenkP22005 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PenkP22005 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PenkP22005 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PenkP22005 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PenkP22005 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PenkP22005 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PenkP22005 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PenkP22005 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PenkP22005 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PenkP22005 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PenkP22005 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PenkP22005 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PenkP22005 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PenkP22005 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PenkP22005 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PenkP22005 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PenkP22005 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PenkP22005 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PenkP22005 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PenkP22005 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PenkP22005 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PenkP22005 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PenkP22005 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PenkP22005 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PenkP22005 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PenkP22005 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PenkP22005 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PenkP22005 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PenkP22005 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PenkP22005 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PenkP22005 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PenkP22005 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PenkP22005 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PenkP22005 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PenkP22005 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PenkP22005 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PenkP22005 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PenkP22005 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PenkP22005 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PenkP22005 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PenkP22005 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PenkP22005 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PenkP22005 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PenkP22005 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PenkP22005 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PenkP22005 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PenkP22005 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PenkP22005 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PenkP22005 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PenkP22005 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PenkP22005 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PenkP22005 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PenkP22005 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PenkP22005 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PenkP22005 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PenkP22005 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PenkP22005 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PenkP22005 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PenkP22005 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PenkP22005 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PenkP22005 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms