Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fcer1aP20489 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fcer1aP20489 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fcer1aP20489 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms