Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama1P19137 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama1P19137 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama1P19137 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama1P19137 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama1P19137 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama1P19137 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama1P19137 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama1P19137 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama1P19137 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama1P19137 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lama1P19137 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lama1P19137 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lama1P19137 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lama1P19137 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama1P19137 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama1P19137 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama1P19137 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama1P19137 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama1P19137 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama1P19137 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama1P19137 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama1P19137 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama1P19137 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama1P19137 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lama1P19137 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lama1P19137 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama1P19137 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lama1P19137 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama1P19137 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama1P19137 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama1P19137 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama1P19137 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama1P19137 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama1P19137 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama1P19137 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama1P19137 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lama1P19137 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lama1P19137 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama1P19137 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama1P19137 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama1P19137 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms