Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.2 ms