Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsdP18242 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsdP18242 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsdP18242 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsdP18242 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsdP18242 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsdP18242 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsdP18242 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtsdP18242 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtsdP18242 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsdP18242 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsdP18242 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtsdP18242 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsdP18242 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsdP18242 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtsdP18242 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms