Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prm2P07978 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prm2P07978 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prm2P07978 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prm2P07978 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prm2P07978 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prm2P07978 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prm2P07978 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prm2P07978 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prm2P07978 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prm2P07978 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prm2P07978 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prm2P07978 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prm2P07978 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms