Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Eb1P04230 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Eb1P04230 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Eb1P04230 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Eb1P04230 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Eb1P04230 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-Eb1P04230 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-Eb1P04230 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Eb1P04230 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Eb1P04230 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Eb1P04230 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Eb1P04230 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Eb1P04230 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Eb1P04230 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Eb1P04230 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Eb1P04230 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Eb1P04230 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2-Eb1P04230 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Eb1P04230 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Eb1P04230 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms