Protein–RNA interactions for Protein: P01807

Ig heavy chain V region X44, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01807 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01807 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01807 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01807 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01807 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
P01807 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01807 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01807 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
P01807 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01807 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01807 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01807 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01807 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01807 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
P01807 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
P01807 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
P01807 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01807 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01807 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
P01807 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01807 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
P01807 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01807 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01807 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01807 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01807 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01807 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01807 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01807 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
P01807 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01807 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01807 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01807 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01807 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01807 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01807 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01807 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01807 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01807 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01807 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01807 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
P01807 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01807 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01807 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
P01807 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01807 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01807 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01807 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01807 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01807 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01807 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01807 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01807 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01807 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01807 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01807 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01807 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01807 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01807 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01807 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01807 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P01807 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01807 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01807 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01807 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
P01807 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01807 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01807 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01807 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01807 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01807 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01807 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01807 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01807 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01807 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
P01807 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01807 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01807 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01807 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01807 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01807 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01807 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01807 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01807 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
P01807 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01807 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01807 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01807 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01807 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01807 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
P01807 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01807 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01807 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
P01807 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01807 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
P01807 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
P01807 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
P01807 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01807 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01807 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms