Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
P01734 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
P01734 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
P01734 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
P01734 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
P01734 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
P01734 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
P01734 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
P01734 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
P01734 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
P01734 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
P01734 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
P01734 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
P01734 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
P01734 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
P01734 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
P01734 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
P01734 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
P01734 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
P01734 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P01734 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P01734 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P01734 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P01734 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P01734 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
P01734 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
P01734 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
P01734 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
P01734 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
P01734 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
P01734 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
P01734 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
P01734 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
P01734 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
P01734 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
P01734 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
P01734 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
P01734 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
P01734 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
P01734 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
P01734 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
P01734 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
P01734 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25■■□□□ 1.59
P01734 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
P01734 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
P01734 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P01734 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P01734 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P01734 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
P01734 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P01734 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P01734 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
P01734 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
P01734 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P01734 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P01734 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
P01734 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
P01734 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
P01734 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
P01734 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
P01734 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P01734 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P01734 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
P01734 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P01734 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P01734 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P01734 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P01734 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P01734 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P01734 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
P01734 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
P01734 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
P01734 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
P01734 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
P01734 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
P01734 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
P01734 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
P01734 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
P01734 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
P01734 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
P01734 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
P01734 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P01734 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
P01734 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
P01734 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
P01734 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
P01734 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
P01734 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
P01734 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
P01734 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
P01734 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
P01734 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
P01734 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
P01734 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
P01734 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
P01734 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P01734 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
P01734 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P01734 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P01734 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.1 ms