Protein–RNA interactions for Protein: O88842

Fgd3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd3O88842 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd3O88842 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd3O88842 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd3O88842 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd3O88842 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd3O88842 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd3O88842 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgd3O88842 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgd3O88842 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgd3O88842 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fgd3O88842 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fgd3O88842 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fgd3O88842 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fgd3O88842 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fgd3O88842 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fgd3O88842 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd3O88842 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd3O88842 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fgd3O88842 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fgd3O88842 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fgd3O88842 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fgd3O88842 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fgd3O88842 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fgd3O88842 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fgd3O88842 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fgd3O88842 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fgd3O88842 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms