Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ShdO88834 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ShdO88834 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ShdO88834 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ShdO88834 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ShdO88834 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ShdO88834 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ShdO88834 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ShdO88834 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ShdO88834 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ShdO88834 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ShdO88834 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ShdO88834 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ShdO88834 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ShdO88834 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ShdO88834 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ShdO88834 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ShdO88834 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ShdO88834 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShdO88834 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShdO88834 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShdO88834 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShdO88834 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ShdO88834 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ShdO88834 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ShdO88834 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ShdO88834 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ShdO88834 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ShdO88834 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ShdO88834 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ShdO88834 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ShdO88834 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ShdO88834 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ShdO88834 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ShdO88834 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ShdO88834 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ShdO88834 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ShdO88834 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ShdO88834 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ShdO88834 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ShdO88834 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ShdO88834 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ShdO88834 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ShdO88834 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ShdO88834 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ShdO88834 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShdO88834 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ShdO88834 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ShdO88834 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ShdO88834 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ShdO88834 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ShdO88834 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ShdO88834 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ShdO88834 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ShdO88834 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ShdO88834 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ShdO88834 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ShdO88834 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ShdO88834 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ShdO88834 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ShdO88834 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ShdO88834 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ShdO88834 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ShdO88834 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ShdO88834 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ShdO88834 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ShdO88834 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ShdO88834 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ShdO88834 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ShdO88834 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ShdO88834 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ShdO88834 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ShdO88834 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ShdO88834 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ShdO88834 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ShdO88834 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ShdO88834 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ShdO88834 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ShdO88834 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ShdO88834 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ShdO88834 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ShdO88834 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ShdO88834 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ShdO88834 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ShdO88834 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ShdO88834 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ShdO88834 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ShdO88834 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ShdO88834 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ShdO88834 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ShdO88834 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ShdO88834 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ShdO88834 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ShdO88834 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ShdO88834 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ShdO88834 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ShdO88834 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ShdO88834 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ShdO88834 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ShdO88834 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms