Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F11rO88792 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F11rO88792 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F11rO88792 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F11rO88792 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
F11rO88792 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F11rO88792 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F11rO88792 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
F11rO88792 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F11rO88792 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F11rO88792 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F11rO88792 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F11rO88792 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F11rO88792 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F11rO88792 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F11rO88792 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F11rO88792 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F11rO88792 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F11rO88792 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F11rO88792 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F11rO88792 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F11rO88792 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F11rO88792 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F11rO88792 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F11rO88792 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F11rO88792 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F11rO88792 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F11rO88792 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
F11rO88792 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F11rO88792 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F11rO88792 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F11rO88792 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F11rO88792 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
F11rO88792 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
F11rO88792 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F11rO88792 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F11rO88792 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F11rO88792 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F11rO88792 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F11rO88792 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F11rO88792 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F11rO88792 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F11rO88792 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F11rO88792 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F11rO88792 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F11rO88792 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
F11rO88792 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F11rO88792 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
F11rO88792 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
F11rO88792 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F11rO88792 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F11rO88792 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
F11rO88792 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F11rO88792 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F11rO88792 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F11rO88792 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F11rO88792 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F11rO88792 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
F11rO88792 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
F11rO88792 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
F11rO88792 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F11rO88792 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F11rO88792 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F11rO88792 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F11rO88792 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F11rO88792 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F11rO88792 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F11rO88792 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
F11rO88792 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
F11rO88792 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
F11rO88792 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
F11rO88792 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
F11rO88792 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
F11rO88792 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
F11rO88792 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
F11rO88792 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
F11rO88792 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
F11rO88792 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F11rO88792 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F11rO88792 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F11rO88792 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F11rO88792 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
F11rO88792 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F11rO88792 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F11rO88792 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F11rO88792 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
F11rO88792 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
F11rO88792 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
F11rO88792 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
F11rO88792 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
F11rO88792 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
F11rO88792 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
F11rO88792 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
F11rO88792 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
F11rO88792 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
F11rO88792 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
F11rO88792 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
F11rO88792 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
F11rO88792 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
F11rO88792 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.9 ms