Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlx3O55144 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlx3O55144 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlx3O55144 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlx3O55144 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlx3O55144 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlx3O55144 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlx3O55144 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlx3O55144 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tlx3O55144 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlx3O55144 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlx3O55144 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlx3O55144 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlx3O55144 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlx3O55144 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlx3O55144 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlx3O55144 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlx3O55144 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlx3O55144 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms