Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cyp26a1O55127 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cyp26a1O55127 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyp26a1O55127 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cyp26a1O55127 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cyp26a1O55127 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cyp26a1O55127 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cyp26a1O55127 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cyp26a1O55127 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cyp26a1O55127 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cyp26a1O55127 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cyp26a1O55127 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cyp26a1O55127 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cyp26a1O55127 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cyp26a1O55127 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Cyp26a1O55127 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cyp26a1O55127 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms