Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mmp15O54732 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mmp15O54732 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp15O54732 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp15O54732 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp15O54732 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp15O54732 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp15O54732 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mmp15O54732 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mmp15O54732 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mmp15O54732 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mmp15O54732 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mmp15O54732 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp15O54732 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp15O54732 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp15O54732 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp15O54732 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp15O54732 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mmp15O54732 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mmp15O54732 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp15O54732 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp15O54732 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp15O54732 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp15O54732 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp15O54732 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mmp15O54732 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp15O54732 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms