Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek2O35942 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek2O35942 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek2O35942 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek2O35942 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek2O35942 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek2O35942 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek2O35942 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek2O35942 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek2O35942 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek2O35942 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek2O35942 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek2O35942 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek2O35942 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek2O35942 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek2O35942 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek2O35942 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek2O35942 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek2O35942 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek2O35942 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek2O35942 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek2O35942 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek2O35942 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek2O35942 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek2O35942 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek2O35942 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek2O35942 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek2O35942 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek2O35942 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek2O35942 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek2O35942 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek2O35942 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek2O35942 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms