Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gp1baO35930 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gp1baO35930 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gp1baO35930 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gp1baO35930 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gp1baO35930 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gp1baO35930 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gp1baO35930 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms