Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pik3cdO35904 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pik3cdO35904 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pik3cdO35904 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pik3cdO35904 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms