Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dsg3O35902 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Dsg3O35902 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dsg3O35902 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dsg3O35902 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dsg3O35902 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms