Protein–RNA interactions for Protein: O35704

Sptlc1, Serine palmitoyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc1O35704 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sptlc1O35704 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sptlc1O35704 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sptlc1O35704 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sptlc1O35704 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sptlc1O35704 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sptlc1O35704 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sptlc1O35704 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sptlc1O35704 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptlc1O35704 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptlc1O35704 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptlc1O35704 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptlc1O35704 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptlc1O35704 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sptlc1O35704 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sptlc1O35704 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sptlc1O35704 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sptlc1O35704 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sptlc1O35704 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sptlc1O35704 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sptlc1O35704 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sptlc1O35704 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sptlc1O35704 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sptlc1O35704 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sptlc1O35704 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sptlc1O35704 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sptlc1O35704 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sptlc1O35704 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sptlc1O35704 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sptlc1O35704 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sptlc1O35704 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptlc1O35704 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptlc1O35704 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptlc1O35704 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptlc1O35704 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptlc1O35704 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptlc1O35704 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sptlc1O35704 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sptlc1O35704 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sptlc1O35704 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sptlc1O35704 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sptlc1O35704 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sptlc1O35704 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sptlc1O35704 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sptlc1O35704 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sptlc1O35704 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sptlc1O35704 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptlc1O35704 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptlc1O35704 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sptlc1O35704 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Sptlc1O35704 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sptlc1O35704 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sptlc1O35704 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sptlc1O35704 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sptlc1O35704 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sptlc1O35704 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms