Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn6O35646 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Capn6O35646 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn6O35646 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn6O35646 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn6O35646 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn6O35646 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn6O35646 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn6O35646 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn6O35646 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn6O35646 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms